Игра в прятки с вирусом: ученые нашли слабое звено Омикрона
Ученые провели большое исследование, чтобы понять, как белок коронавируса взаимодействует с нашей иммунной системой.
Они сравнили фрагменты белков (пептиды) пяти разных штаммов вируса с молекулами на поверхности зараженных клеток человека. Оказалось, что три пептида штамма Омикрон лучше всего связываются с этими молекулами. Это открытие может помочь создать более эффективные вакцины против COVID-19.
Результаты исследования, поддержанного грантом Российского научного фонда (РНФ), опубликованы в журнале iScience.
Когда вирус попадает в клетку, она начинает защищаться. Внутри клетки есть специальные «фабрики» — протеасомы, которые разрушают вирусные белки на мелкие кусочки. Эти кусочки затем выставляются на поверхность клетки, где их замечают Т-лимфоциты — клетки иммунной системы. Они начинают атаковать зараженные клетки, чтобы остановить распространение вируса. Изучение этого процесса помогает ученым понять, как улучшить вакцины.
Ученые из Института биоорганической химии имени Шемякина и Овчинникова вместе с коллегами из НИИ системной биологии и медицины исследовали белок S пяти штаммов коронавируса: Ухань-Ху-1, Альфа, Дельта, Гамма и Омикрон. Именно этот белок первым контактирует с клетками человека, и против него вырабатываются антитела после вакцинации.
Оказалось, что белок Омикрона разрушается иначе, чем у других штаммов. Это влияет на то, как его фрагменты связываются с молекулами на поверхности клеток. Ученые выделили 821 уникальный пептид и сравнили их с 18 771 вариантом молекул, которые встречаются у людей. Три пептида Омикрона показали себя лучше всего.
Это объясняет, почему некоторые люди легче переносят Омикрон или вообще не заражаются. Два из этих трех пептидов сохранились и в новых вариантах вируса, что делает их важными для иммунного ответа. Эти данные могут стать основой для новых вакцин, которые будут лучше защищать от коронавируса.
Наше исследование не только помогает понять, как вирус взаимодействует с иммунной системой, но и дает конкретные подсказки для создания вакцин нового поколения. Мы продолжим изучать вирусы, чтобы найти универсальные компоненты иммунного ответа и разработать стратегии защиты, — говорит Анна Кудряева, руководитель проекта, старший научный сотрудник Института биоорганической химии.
Ранее ученые выяснили, что грибковая инфекция вдвое увеличивает смертность при COVID-19.
Фото: Работа с клетками млекопитающих. Источник: Анна Кудряева.
