Результаты исследования опубликованы в журнале Cell Press.

Гамма-дельта Т-клетки, несмотря на то что их меньше, чем других клеток, становятся всё более важными для иммунной системы. Они могут задействовать как врождённый, так и адаптивный иммунитет.

Учёные из Университета Моффитта вместе с коллегами из Дартмутского колледжа и Университета Дьюка использовали новый метод анализа рецепторов гамма-дельта T-клеток. Они изучили 11 000 опухолей и создали базу данных, которая поможет отслеживать развитие рака и реакцию на лечение, в том числе иммунотерапию.

Это как искать иголку в стоге сена, — говорит Сюэфэн Ванг, заведующий кафедрой биостатистики и биоинформатики Моффитта.

После двух лет работы мы просеяли около 700 миллиардов считываний РНК опухолей и отобрали 3,2 миллиона считываний гамма-дельта Т-клеток. Это поможет изучить клоны гамма-дельта Т-клеток и понять, как они влияют на выживаемость пациентов и эффективность лечения.

Основные результаты исследования:

• Исследователи создали базу данных последовательностей рецепторов гамма-дельта Т-клеток при разных видах рака. Это ценный ресурс для изучения этих иммунных компонентов.
• Анализ позволил выявить несколько генов, которые могут служить прогностическими биомаркерами при различных видах рака, таких как плоскоклеточная карцинома головы и шеи и аденокарцинома толстой кишки.
• Исследование показало, что более высокие показатели обогащения генов рецепторов гамма-дельта Т-клеток связаны с лучшим ответом на иммунотерапию. Это подчёркивает необходимость разработки персонализированных подходов к лечению, включающих сигнатуры гамма-дельта Т-клеток.
• Гамма-дельта Т-клетки чаще встречаются в микроокружении опухоли, чем в нормальных тканях. Это позволяет предположить, что они играют особую роль в иммунной защите организма. Однако их влияние на развитие заболевания зависит от молекулярных характеристик опухоли и состояния пациента.

Учёные будут расширять базу данных исследования, добавляя в неё информацию о Т-клеточных рецепторах и их функциях. Для этого будет проведён анализ секвенирования РНК одной клетки. Это поможет лучше понять роль гамма-дельта Т-клеток при раке и то, как они взаимодействуют с микроокружением опухоли.

По словам Ванга, это исследование не только расширяет знания о гамма-дельта Т-клетках, но и открывает новые возможности для создания методов лечения рака. Понимание роли этих клеток позволит подбирать более эффективное лечение для пациентов.

Иллюстрация: нейросеть